Depuis quelques temps, les relations entre ces deux républiques semblent se tendre, et il est difficile de savoir comment la situation pourrait évoluer par la suite. Sur le terrain, l'Ouzbékistan concentre son matériel militaire près de sa frontière avec le Tadjikistan, largement minée. Les autorités des deux Etats ont leur propre point de vue sur cette méfiance réciproque et les tensions qui en découlent. Superposée aux autres problèmes de la vallée du Ferghana (tensions inter-ethniques, trafic de drogue, pauvreté endémique), la détérioration des relations ouzbéko-tadjikes fait peser une lourde menace sur la sécurité de toute la région.